11月30日上午，由国家发改委、教育部、总后勤部和北京市投资12.22亿元，军事医学科学院联合清华大学、北京大学、中国科学院生物物理研究所共同承建的国家蛋白质科学基础设施——北京基地（凤凰工程）在中关村生命科学园举行开工奠基仪式。副市长张工、总后卫生部副部长方国恩、教育部部长助理陈舜、国家发改委高技术产业司司长綦成元、中科院副院长张亚平、清华大学副校长邱勇、北京大学常务副校长王恩哥、昌平区常务副区长张燕友、中关村管委会副主任白智勇及军事医学科学院院长贺福初等领导出席。中关村发展集团总经理许强应邀出席。
　　“凤凰工程”总部位于中关村生命科学园，占地面积2.53万平方米，科研大楼建筑面积3.73万平方米，计划于2015年5月竣工。
　　根据规划，军事医学科学院承担“凤凰工程”总部设施建设，清华大学、北京大学分别承担以冷冻电镜、高频核磁为主的辅助设施建设，并吸纳中科院生物物理研究所现有的蛋白质研究平台，组建国家蛋白质科学中心（北京），从而打造成世界蛋白质科学领域的核心基地和研究旗舰。大楼根据使用需求设计了不同的功能分区，将构建以蛋白质组分析系统、蛋白质结构解析系统、蛋白质功能研究系统为核心，以生物信息学、蛋白质制备等分系统为支撑蛋白质科学研究平台，可为超过500名科研人员提供良好的科研工作条件、学术交流场所和生活综合服务保障。
　　2004年初，基于成功领衔“国际人类肝脏蛋白质组计划”这一引领世界生命科学发展的历史机遇，军事医学科学院正式向国家发改委呈报了“凤凰工程”方案。2006年，国家决定在北京和上海分别建设蛋白质科学基础设施。上海设施总投资7亿，由中国科学院上海生命科学研究院负责建设，已于2010年12月在上海张江高科技园区率先启动。

作为北京生命科学领域最大的单体项目、北京市军民融合示范工程，“凤凰工程”的建设将成为中关村国家自主创新示范区先行示范窗口的重要载体，为促进北京生物等领域战略性新兴产业的发展起到积极推动作用。